Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms