Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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