Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8VDP2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8VDP2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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