Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d2Q8VD57 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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