Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms