Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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