Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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