Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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