Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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