Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps53Q8CCB4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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