Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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