Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms