Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8C708 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8C708 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8C708 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8C708 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms