Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Q8C5C9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8C5C9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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