Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm11871-201ENSMUST00000122429 1061 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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