Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms