Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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