Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms