Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms