Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms