Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms