Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GypcQ78HU7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms