Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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