Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssx9Q6XAS3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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