Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms