Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt39Q6IFX4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms