Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Krt40Q6IFX3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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