Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q6DFW0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms