Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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