Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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