Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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