Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms