Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms