Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5dQ62240 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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