Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms