Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms