Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim58Q5NCC9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms