Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms