Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm4Q4VBF2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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