Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxn3Q499D0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxn3Q499D0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms