Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC051142Q3V0M8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC051142Q3V0M8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC051142Q3V0M8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC051142Q3V0M8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC051142Q3V0M8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051142Q3V0M8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC051142Q3V0M8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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