Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms