Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn13Q3UW68 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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