Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms