Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp30Q3UN04 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp30Q3UN04 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp30Q3UN04 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp30Q3UN04 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp30Q3UN04 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp30Q3UN04 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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