Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms