Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mier3Q3UHF3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mier3Q3UHF3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms