Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Q3U6N9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Q3U6N9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q3U6N9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms