Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms