Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88bQ3TYP4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms